Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SP140Q13342 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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