Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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