Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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