Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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