Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRDM2Q13029 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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