Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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