Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms