Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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