Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PHACTR1Q9C0D0 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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PHACTR1Q9C0D0 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PHACTR1Q9C0D0 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PHACTR1Q9C0D0 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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