Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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