Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms