Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms