Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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