Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms