Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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