Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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NDUFA9Q16795 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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NDUFA9Q16795 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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NDUFA9Q16795 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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NDUFA9Q16795 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NDUFA9Q16795 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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