Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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