Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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GRIK5Q16478 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK5Q16478 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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