Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms