Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms