Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPTX1Q15818 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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