Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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