Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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