Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.3 ms