Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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