Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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