Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms