Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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