Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHROOM2Q13796 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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