Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CLN3Q13286 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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