Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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GRIK3Q13003 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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