Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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