Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms