Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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