Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PITPNM1O00562 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms