Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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