Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NBPF3Q9H094 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms