Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KCNS3Q9BQ31 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KCNS3Q9BQ31 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms