Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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