Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms