Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
UBXN4Q92575 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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