Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL356273.2-201ENST00000413701 973 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC005841.1-201ENST00000547042 287 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-AS1-206ENST00000550426 683 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-AS1-211ENST00000552990 654 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC011465.1-201ENST00000599092 328 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC007663.4-201ENST00000608275 631 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MYL6BP1-201ENST00000429485 615 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SL792P-201ENST00000496286 305 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms