Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDO1Q16878 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDO1Q16878 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDO1Q16878 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDO1Q16878 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDO1Q16878 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDO1Q16878 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDO1Q16878 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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