Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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RTN1Q16799 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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