Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAMA3Q16787 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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