Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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