Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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RPE65Q16518 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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RPE65Q16518 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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RPE65Q16518 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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RPE65Q16518 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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RPE65Q16518 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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