Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms