Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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GRIK4Q16099 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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GRIK4Q16099 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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GRIK4Q16099 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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