Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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